За какво се използва NCBI BLAST?
Основният инструмент за търсене на локално подравняване (BLAST) намира области с локално сходство между протеинови или нуклеотидни последователности. Програмата сравнява нуклеотидни или протеинови последователности с последователности в база данни и изчислява статистическата значимост на съвпаденията.
Софтуер ли е NCBI BLAST?
През 1990 г. изследователи от Националния център за биотехнологична информация (NCBI) пуснаха нов софтуерен пакет за бързо сравнение на ДНК и протеинова последователност [15].
Как намирате BLAST?
Търсене на подобие на BLAST последователност
- Изберете раздела „Blast“ на лентата с инструменти в горната част на страницата, за да стартирате търсене на сходство на последователността с програмата Blast.
- Въведете или протеинова или нуклеотидна последователност или UniProt идентификатор в полето за формуляр (Фигура 37).
- Щракнете върху бутона „Run Blast“.
Какво е NCBI GenBank?
GenBank® е изчерпателна база данни, която съдържа публично достъпни нуклеотидни последователности за повече от 300 000 организми, посочени на ниво род или по-ниско, получени предимно чрез представяне от отделни лаборатории и партидни заявки от мащабни проекти за секвениране, включително цяла геномна пушка ( ...